ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΙΣ ΕΙΔΙΚΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΒΙΟΑΠΕΙΚΟΝΙΣΗΣ

• Μπορεί η απεικόνιση να δώσει απάντηση σε ένα βιολογικό ερώτημα;
• Ποια τεχνική θα πρέπει να χρησιμοποιηθεί για μια συγκεκριμένη εφαρμογή;
• Πώς ακριβώς λειτουργεί μια συγκεκριμένη τεχνική απεικόνισης και ποιοι είναι οι υποκείμενοι φυσικοί μηχανισμοί που αξιοποιεί;
• Τι είδους πληροφορία μπορεί να δώσει κάθε τεχνική;
• Ποια τα πλεονεκτήματα της κάθε απεικονιστικής τεχνικής και ποιοι οι περιορισμοί της;
• Πως αναλύονται και ερμηνεύονται οι καταγραφόμενες εικόνες;

ΥΠΟΛΟΓΙΣΤΙΚΗ ΤΟΜΟΓΡΑΦΙΑ ΑΚΤΙΝΩΝ Χ

• Τί είναι οι ακτίνες Χ και πώς παράγονται;
• Πώς αλληλεπιδρούν με τον ιστό;
• Πώς λειτουργεί ένας σύγχρονος αξονικός τομογράφος;
• Πώς γίνεται η ανακατασκευή των εικόνων;
• Τί είδους βιολογική πληροφορία μπορούν να μας παρέχουν;

ΤΟΜΟΓΡΑΦΙΑ ΕΚΠΟΜΠΗΣ ΠΟΖΙΤΡΟΝΙΟΥ (PET)

• Τι είναι ραδιενέργεια, πώς προκύπτει και ποιες είναι οι τρεις μορφές της;
• Πως προκύπτει το σήμα σε μια διάταξη PET;
• Ποια είναι τα τυπικά ραδιοϊσότοπα που χρησιμοποιούνται στο PET και τι χαρακτηριστικά έχουν;
• Πώς γίνεται η ανίχνευση της εκπομπής ποζιτρονίου από έναν ραδιενεργό πυρήνα;
• Από ποιους παράγοντες εξαρτάται η χωρική ανάλυση της τεχνικής;
• Πώς γίνεται η ανακατασκευή της εικόνας στο PET;
• Ποιες είναι οι τυπικές εφαρμογές του PET;

ΥΠΕΡΗΧΟΓΡΑΦΙΚΕΣ ΤΕΧΝΙΚΕΣ ΑΠΕΙΚΟΝΙΣΗΣ

• Ποια είναι τα πλεονεκτήματα και οι περιορισμοί της υπερηχογραφίας;
• Ποιοι νόμοι διέπουν την ανάκλαση, διάθλαση και εξασθένηση των υπερήχων μέσα στους ιστούς;
• Τι είναι το πιεζοηλεκτρικό φαινόμενο και πώς αυτό σχετίζεται με την παραγωγή και ανίχνευση των υπερήχων;
• Ποιες είναι οι διαφορές της υπερηχογραφίας A-Scan από τη Β-Scan;
• Με ποιους βασικούς τρόπους επιτυγχάνεται η σάρωση της δέσμης για την απόκτηση εικόνας στο B-Scan;
• Από τι εξαρτάται η χωρική ανάλυση και το μέγιστο βάθος απεικόνισης;
• Πώς μπορούμε να μετρήσουμε ταχύτητες ροής μέσω φαινομένου Doppler;
• Ποιες είναι οι βασικές εφαρμογές της υπερηχογραφίας;

ΦΩΤΟΑΚΟΥΣΤΙΚΗ ΤΟΜΟΓΡΑΦΙΑ

• Τί είναι το φωτοακουστικό φαινόμενο;
• Πώς συνδέεται η φωτοακουστική πίεση με τις παραμέτρους του απορροφητή και του λέιζερ;
• Ποιοι είναι οι ενδογενείς απορροφητές στους ιστούς;
• Τί εξωγενείς παράγοντες αντίθεσης μπορούν να χρησιμοποιηθούν και ποια πληροφορία μπορούν να δώσουν;
• Πώς λειτουργούν τα φωτοακουστικά τομογραφικά συστήματα;
• Πώς επιτυγχάνεται η ανακατασκευή των φωτοακουστικών εικόνων;
• Τί είδους βιολογική πληροφορία μπορεί να δώσει η φωτοακουστική τομογραφία;

ΕΙΣΑΓΩΓΗ ΣΤΗΝ ΟΠΤΙΚΗ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ

• Τι είδους βιολογικές παρατηρήσεις έγιναν με τα πρώτα μικροσκόπια κατά το 17ο έως 19ο αιώνα;
• Πότε και γιατί ήλθε στο προσκήνιο το σύνθετο οπτικό μικροσκόπιο;
• Ποιοι οι κανόνες του ray-tracing και πως αυτοί εφαρμόζονται στο μικροσκόπιο;
• Ποια είναι τα βασικά είδη των οπτικών μικροσκοπίων;
• Τί είναι περίθλαση και πως συνδέεται η περιγραφή της με την αρχή Huygens;
• Πώς προκύπτει η σχέση Abbe για τη χωρική ανάλυση ενός μικροσκοπίου;
• Τί ειναι ο φωτισμός Köhler και τι πλεονεκτηματα προσφέρει;
• Ποιες είναι οι βασικές οπτικές εκτροπές σε ένα μικροσκόπιο;
• Τι σημαίνουν τα στοιχεία που αναγράφονται σε έναν αντικειμενικό φακό;

ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ ΦΘΟΡΙΣΜΟΥ Ι

• Τί είναι φθορισμός και πως αναπαρίσταται σε διάγραμμα Jablonski;
• Πώς λειτουργεί ένα widefield μικροσκόπιο φθορισμού;
• Ποια είναι τα βασικά είδη φίλτρων και διχροϊκών κατόπτρων;
• Ποιες είναι οι δύο τεχνολογίες φίλτρων και τι προσφέρει η κάθε μία;
• Τί είναι η φωτολεύκανση και πως μπορεί να αντιμετωπιστεί;
• Τι δυνατότητες προσφέρει το συνεστιακό μικροσκόπιο σε σχέση με το widefield;
• Ποια είναι η αρχή λειτουργίας της συνεστιακής μικροσκοπίας;
• Από ποιες σχέσεις δίνεται η χωρική ανάλυση ενός μικροσκοπίου φθορισμού λόγω περίθλασης και πως αυτές προκύπτουν;

ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ ΦΘΟΡΙΣΜΟΥ ΙΙ

• Ποια είναι η βασική αρχή λειτουργίας της μικροσκοπίας SPIM;
• Ποια είναι τα πλεονεκτήματα του SPIM σε σύγκριση με το confocal / widefield;
• Πως μπορούμε να παράξουμε ένα φύλλο φωτός;
• Ποιες είναι οι βασικές παράμετροι των γκαουσιανών δεσμών και πως σχετίζονται μεταξύ τους;
• Πως συνδέεται το πεδίο θέασης με το πλάτος του φύλλου φωτός;
• Από τι εξαρτάται η πλευρική και αξονική ανάλυση στο SPIM;
• Ποια είναι τα κύρια προβλήματα που παρουσιάζονται στο SPIM με φωτισμό από μία μόνο πλευρά;
• Ποιες είναι οι πέντε κύριες προσεγγίσεις μικροσκοπίας SPIM;
• Ποιες είναι οι σπουδαιότερες εφαρμογές της μικροσκοπίας SPIM;

ΜΗ ΓΡΑΜΜΙΚΗ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ

• Ποιοι είναι οι βασικοί σκεδαστές και απορροφητές εντός των ιστών στην ορατή περιοχή του φάσματος;
• Ποια είναι τα δύο είδη σκέδασης του φωτός εντός του ιστού;
• Τι ονομάζουμε οπτικό παράθυρο του ιστού;
• Τι είναι ο διφωτονικά διεγειρόμενος φθορισμός και σε τι διαφέρει από τη μονοφωτονική περίπτωση;
• Τι είναι η αρχή της απροσδιοριστίας χρόνου – ενέργειας και πως αυτή συνδέεται με τις εικονικές καταστάσεις;
• Ποιες είναι οι τυπικές παράμετροι λέιζερ για την απόκτηση μη γραμμικού σήματος;
• Ποια είναι τα πλεονεκτήματα της μη γραμμικής μικροσκοπίας έναντι του confocal;
• Τι είναι οι οπτικές αρμονικές, πότε παράγονται και τι πληροφορία μπορούν να δώσουν;

ΦΩΤΟΑΚΟΥΣΤΙΚΗ ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ

• Ποια είναι τα δύο είδη της φωτοακουστικής μικροσκοπίας και ποιες οι διαφορές μεταξύ τους;
• Πώς καθορίζεται η χωρική ανάλυση και το βάθος απεικόνισης σε κάθε περίπτωση;
• Ποια πιστεύετε πως είναι τα πλεονεκτήματα της φωτοακουστικής μικροσκοπίας έναντι των αμιγώς οπτικών τεχνικών μικροσκοπίας;
• Πως λειτουργεί ο γραμμικός φασματικός διαχωρισμός απορροφητών;
• Ποιες ειναι οι κύριες εφαρμογές της φωτοακουστικής μικροσκοπίας στη βασική έρευνα;

ΜΙΚΡΟΣΚΟΠΙΑ CARS

• Τι ειναι η αυθόρμητη σκέδαση Raman και σε τι διαφέρει από τη σκέδαση Rayleigh;
• Τι δείχνει ένα φάσμα Raman και ποιες είναι οι πιο σημαντικές κορυφές βιολογικού ενδιαφέροντος;
• Ποια τα πλεονεκτήματα και ποια τα μειονεκτήματα της απόκτησης φασμάτων αυθόρμητης σκέδασης Raman; Γιατί η τεχνική αυτή δεν είναι η πλέον κατάλληλη για απεικόνιση;
• Τι είναι και πως προκύπτουν τα διακροτήματα; Τι ονομάζεται beat frequency;
• Πως προκύπτει το φαινόμενο CARS; Τί είναι το SRG και SRL;
• Ποια είναι τα βασικά πλεονεκτήματα της μικροσκοπίας CARS και ποιες ειναι οι τυπικές εφαρμογές της στη βιολογία;

ΝΑΝΟΣΚΟΠΙΑ

• Τι ειναι η περίθλαση και πως συνδέεται με τη χωρική διακριτική ικανότητα ενός μικροσκοπίου;
• Ποιες είναι οι τρεις διαδικασίες αλληλεπίδρασης ακτινοβολίας – ύλης;
• Πως σχηματίζεται μια δέσμη doughnut;
• Ποια είναι η αρχή λειτουργίας της μικροσκοπίας STED;
• Από τι εξαρτάται η χωρική ανάλυση τη τεχνικής STED και μέχρι τι τιμές μπορεί να φτάσει;